活動信息
時間:09月17日 16:00
形式:免費線上直播
文獻研究背景
植物的根往往被土壤細菌所侵染,這些細菌被認為是抗生素抗性基因(ARGs)的主要接納體。ARGs可以在這些微生物和病原體之間轉移,但這些ARGs和病原體在多大程度上從土壤傳播到植物的機制還不清楚。作者使用擴增子和宏基因組測序研究了紅樹林幼樹土壤-根系連續體的高分辨率抗性剖面。數據顯示,91.4%的ARGs在4個與根系相關的空間(內圈、epis圈、根圈和未種植土壤)共享。與微生物區隔選擇動力學不同,導入以一種連續的方式散布在土壤-根系連續體上。這種傳播與潛在的根系相關的細菌和真菌微生物群無關,但可能是由多種可移動遺傳元素促進。創傷弧菌、致病性大腸埃希菌和肺炎克雷伯菌作為多藥耐藥病原菌,在4個隔室中均占主導地位,表明抗生素病原菌可能沿土壤-根系連續體傳播。通過解讀根系相關抗性和病原體的形態和動態,作者的研究確定了土壤-根系連續體是一個相互連接的匯,通過它,某些ARGs和病原體可以從土壤流向植物。
本期文獻秀,我們就邀請了本文的第一作者胡瑞文博士來給大家分享該篇文獻的科研經歷。
本期分享文獻
文獻題目:Prevalence of antibiotic resistance genes and bacterial pathogens along the soil-mangrove root continuum
發表期刊:《Journal of Hazardous Materials 》
發表時間:2021年4月
影響因子:10.588
第一作者:胡瑞文 中山大學
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https://mp.weixin.qq.com/s/mSf-OFUapJw6Upy1Yf9BYg
本期分享嘉賓
胡瑞文 博士
主要從事環境微生物組相關研究,關注的研究方向:1,環境污染物的微生物降解;2,環境微生物的相互作用機制; 3,河口與海洋生態系統中微生物介導的元素循環。
張雨 研發工程師
畢業于武漢大學,具有5年微生物組學研究經驗,目前負責宏基因組生信分析相關研發工作。
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